起源于古希腊，与奥运会有关。
1. 马拉松比赛的起源可追溯至公元前490年古代希腊城邦阿波罗尼亚的战役。
根据传说，一位名为菲利比德斯的信使奔跑了近五十英里来传递胜利的消息。
2. 马拉松比赛正式成为现代奥运会比赛项目是在20世纪末开始的。
由于古希腊马拉松的传统，19世纪后期开始的马拉松竞赛便可追溯至古希腊。
1936年在柏林奥运会上，马拉松作为正式比赛项目列入比赛日程中。
综上，可以得出马拉松比赛的起源与古希腊有关，成为现代奥运比赛项目的原因也有直接的关系于奥运会。
与传递军事捷报有关，公元前490年波斯和雅典发生军事战争，雅典人打败了波斯取得胜利，为了把这个胜利消息早日告诉国民，派遗一名土兵跑回去，这名士兵不停跑，最后累死，为了纪念这个士兵，诞生了马拉松比赛。
马拉松比赛的起源与古希腊的历史有关，但它在现代奥林匹克运动会中也有很重要的地位。1896年第一届现代奥林匹克运动会在雅典举行时，就在比赛日程中加入了马拉松比赛项目，以纪念古希腊传说中的跑步士兵菲迪皮德斯（Pheidippides）跑步传送胜利信讯的壮举。因此奥运会上的马拉松比赛被视为现代马拉松的起源之一。
马拉松比赛项目的起源要从公元前490年9月12日发生的一场战役讲起。
这场战役是波斯人和雅典人在离雅典不远的马拉松平原发生的，史称希波战争，雅典人最终获得了反侵略的胜利。为了让故乡人民尽快知道胜利的喜讯，统帅米勒狄派一个叫菲迪皮茨的士兵回去报信。
菲迪皮茨是个有名的“飞毛腿”，为了让故乡人早知道好消息，他一个劲地快跑，当他跑到雅典时，已上气不接下气，激动地喊道“欢乐吧，雅典人，我们胜利了”说完，就倒在地上死了。
为了纪念这一事件，在1896年举行的现代第一届奥林匹克运动会上，设立了马拉松赛跑这个项目，把当年菲迪皮茨送信跑的里程——42.193公里作为赛跑的距离。
奥运会上的马拉松比赛起源于希腊古代的传说。据传说，公元前490年，波斯军队入侵古希腊，雅典城派出一名士兵费德里彻传递战斗的消息，他从马拉松到雅典的路程约为40公里。费德里彻在疲劳不堪的情况下跑完全程，到达雅典后倒下并去世。因此，现代马拉松比赛的起点就设在马拉松，并且比赛的距离为42.95公里，这是因为在908年伦敦奥运会上，为了让比赛的起点与英国王室的起点（温莎城堡）相同，将比赛的距离延长了385码，即约为352米。
其实,马拉松原本是希腊一平原的名字。公元前490年9月7日,波斯军队组成了庞大的舰队,横渡爱琴海,直逼雅典。面对强大的波斯入侵者,雅典感到独木难支,便派遣擅跑的传令兵菲迪皮茨Pheidippides)星夜奔往斯巴达求援。菲迪皮茨在两天内跑了150千米,于9月9日到达斯巴达。可是,斯巴达人不愿出兵帮助雅典,为此百般推托。
在强敌面前,雅典人表现出了英勇不屈、视死如归的英雄气概。9月12日,约1万波斯士兵在马拉松登陆,雅典军队与侵略者展开了决战,结果雅典以少胜多,歼敌6400多人,缴获大批舰船,而自身折兵不足200人 雅典军队在马拉松获胜后,雅典统帅立即派菲迪皮茨跑回雅典报喜。刚从斯巴达返回的菲迪皮茨又上路了,他不停地奔跑,到雅典时已经筋疲力尽。最终,他只喊了一句“欢呼吧,我们胜利了”便倒地不起,气绝身亡。希腊人从此将菲迪皮茨视为为国尽忠的英雄。
公元1890年,当第一届现代奥林匹克运动会在希腊雅典召开时,有人建议增设一项超长距离的赛跑项目,全程42195米,即从马拉松到雅典的距离,并将之命名为“马拉松长跑”,以此纪念希腊历史上的那场战役以及那位令人敬佩的长跑英雄。这就是马拉松长跑的由来
